Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pnpla6Q3TRM4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pnpla6Q3TRM4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pnpla6Q3TRM4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms