Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc4Q3TR08 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms