Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdlim7Q3TJD7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pdlim7Q3TJD7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms