Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtf2f1Q3THK3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2f1Q3THK3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms