Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zfp444Q3TDV8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zfp444Q3TDV8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zfp444Q3TDV8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfp444Q3TDV8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp444Q3TDV8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms