Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RubcnlQ3TD16 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RubcnlQ3TD16 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms