Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Riiad1Q3KNY5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms