Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hdgfl1Q2VPR5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hdgfl1Q2VPR5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hdgfl1Q2VPR5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hdgfl1Q2VPR5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdgfl1Q2VPR5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdgfl1Q2VPR5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdgfl1Q2VPR5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdgfl1Q2VPR5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdgfl1Q2VPR5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdgfl1Q2VPR5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdgfl1Q2VPR5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdgfl1Q2VPR5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdgfl1Q2VPR5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdgfl1Q2VPR5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdgfl1Q2VPR5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdgfl1Q2VPR5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdgfl1Q2VPR5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdgfl1Q2VPR5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hdgfl1Q2VPR5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdgfl1Q2VPR5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdgfl1Q2VPR5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdgfl1Q2VPR5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdgfl1Q2VPR5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdgfl1Q2VPR5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdgfl1Q2VPR5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdgfl1Q2VPR5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hdgfl1Q2VPR5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms