Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ush2AQ2QI47 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ush2AQ2QI47 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ush2AQ2QI47 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ush2AQ2QI47 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ush2AQ2QI47 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ush2AQ2QI47 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ush2AQ2QI47 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ush2AQ2QI47 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ush2AQ2QI47 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ush2AQ2QI47 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ush2AQ2QI47 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ush2AQ2QI47 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ush2AQ2QI47 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ush2AQ2QI47 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ush2AQ2QI47 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ush2AQ2QI47 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ush2AQ2QI47 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ush2AQ2QI47 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ush2AQ2QI47 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ush2AQ2QI47 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ush2AQ2QI47 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ush2AQ2QI47 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ush2AQ2QI47 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ush2AQ2QI47 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ush2AQ2QI47 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ush2AQ2QI47 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ush2AQ2QI47 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms