Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samd11Q1RNF8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samd11Q1RNF8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms