Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm1123Q1RME4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm1123Q1RME4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms