Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tdrd9Q14BI7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
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Tdrd9Q14BI7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
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Tdrd9Q14BI7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
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Tdrd9Q14BI7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
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Tdrd9Q14BI7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tdrd9Q14BI7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
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Tdrd9Q14BI7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
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Tdrd9Q14BI7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tdrd9Q14BI7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tdrd9Q14BI7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tdrd9Q14BI7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tdrd9Q14BI7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
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Tdrd9Q14BI7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tdrd9Q14BI7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tdrd9Q14BI7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tdrd9Q14BI7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tdrd9Q14BI7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
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Tdrd9Q14BI7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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Tdrd9Q14BI7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tdrd9Q14BI7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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Tdrd9Q14BI7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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Tdrd9Q14BI7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
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Tdrd9Q14BI7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tdrd9Q14BI7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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Tdrd9Q14BI7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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