Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8b1Q148W0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8b1Q148W0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8b1Q148W0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8b1Q148W0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8b1Q148W0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8b1Q148W0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8b1Q148W0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8b1Q148W0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8b1Q148W0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8b1Q148W0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8b1Q148W0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp8b1Q148W0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp8b1Q148W0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp8b1Q148W0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
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Atp8b1Q148W0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
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Atp8b1Q148W0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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Atp8b1Q148W0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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Atp8b1Q148W0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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Atp8b1Q148W0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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Atp8b1Q148W0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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Atp8b1Q148W0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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Atp8b1Q148W0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp8b1Q148W0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atp8b1Q148W0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atp8b1Q148W0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp8b1Q148W0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Atp8b1Q148W0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp8b1Q148W0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp8b1Q148W0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp8b1Q148W0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms