Protein–RNA interactions for Protein: Q0WXH6

Gm7030, MHC class Ib T9, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7030Q0WXH6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm7030Q0WXH6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm7030Q0WXH6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm7030Q0WXH6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm7030Q0WXH6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm7030Q0WXH6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms