Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG34

4930480E11Rik, MCG52719, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930480E11RikQ0VG34 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
4930480E11RikQ0VG34 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930480E11RikQ0VG34 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms