Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b3Q0VF55 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp2b3Q0VF55 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms