Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn2bQ0KL01 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn2bQ0KL01 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn2bQ0KL01 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms