Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kndc1Q0KK55 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kndc1Q0KK55 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms