Protein–RNA interactions for Protein: Q09324

Gcnt1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt1Q09324 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gcnt1Q09324 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms