Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc7a1Q09143 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms