Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cass4Q08EC4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cass4Q08EC4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms