Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CbfbQ08024 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CbfbQ08024 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms