Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
F13bQ07968 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
F13bQ07968 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
F13bQ07968 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
F13bQ07968 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F13bQ07968 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F13bQ07968 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
F13bQ07968 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13bQ07968 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13bQ07968 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13bQ07968 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
F13bQ07968 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
F13bQ07968 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13bQ07968 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms