Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
Pou6f1Q07916 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou6f1Q07916 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms