Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MestQ07646 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MestQ07646 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MestQ07646 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MestQ07646 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MestQ07646 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MestQ07646 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MestQ07646 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MestQ07646 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MestQ07646 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MestQ07646 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MestQ07646 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MestQ07646 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MestQ07646 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MestQ07646 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MestQ07646 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MestQ07646 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MestQ07646 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MestQ07646 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MestQ07646 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MestQ07646 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MestQ07646 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MestQ07646 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MestQ07646 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MestQ07646 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MestQ07646 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MestQ07646 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MestQ07646 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MestQ07646 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MestQ07646 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MestQ07646 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MestQ07646 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MestQ07646 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MestQ07646 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MestQ07646 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MestQ07646 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MestQ07646 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MestQ07646 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MestQ07646 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MestQ07646 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MestQ07646 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MestQ07646 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MestQ07646 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MestQ07646 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MestQ07646 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MestQ07646 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MestQ07646 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MestQ07646 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MestQ07646 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MestQ07646 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MestQ07646 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MestQ07646 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MestQ07646 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MestQ07646 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MestQ07646 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MestQ07646 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MestQ07646 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MestQ07646 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MestQ07646 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MestQ07646 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
MestQ07646 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MestQ07646 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MestQ07646 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MestQ07646 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MestQ07646 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MestQ07646 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MestQ07646 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MestQ07646 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MestQ07646 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MestQ07646 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MestQ07646 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MestQ07646 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MestQ07646 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MestQ07646 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MestQ07646 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MestQ07646 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MestQ07646 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MestQ07646 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MestQ07646 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MestQ07646 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MestQ07646 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MestQ07646 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MestQ07646 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MestQ07646 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MestQ07646 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MestQ07646 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MestQ07646 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MestQ07646 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MestQ07646 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MestQ07646 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MestQ07646 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MestQ07646 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MestQ07646 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MestQ07646 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MestQ07646 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MestQ07646 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MestQ07646 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MestQ07646 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MestQ07646 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MestQ07646 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms