Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nfe2Q07279 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nfe2Q07279 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms