Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Sh3bp2Q06649 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp2Q06649 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms