Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atf4Q06507 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms