Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcr5Q04683 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcr5Q04683 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms