Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms