Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Kcnb1Q03717 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms