Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scg2Q03517 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scg2Q03517 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scg2Q03517 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms