Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msx2Q03358 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msx2Q03358 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms