Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nucb1Q02819 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nucb1Q02819 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nucb1Q02819 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nucb1Q02819 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nucb1Q02819 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nucb1Q02819 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nucb1Q02819 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nucb1Q02819 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nucb1Q02819 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nucb1Q02819 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nucb1Q02819 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nucb1Q02819 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nucb1Q02819 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nucb1Q02819 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nucb1Q02819 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nucb1Q02819 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nucb1Q02819 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nucb1Q02819 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nucb1Q02819 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nucb1Q02819 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nucb1Q02819 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nucb1Q02819 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nucb1Q02819 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nucb1Q02819 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nucb1Q02819 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nucb1Q02819 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nucb1Q02819 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nucb1Q02819 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nucb1Q02819 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms