Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snai1Q02085 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snai1Q02085 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms