Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec23aQ01405 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms