Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EgfrQ01279 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EgfrQ01279 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms