Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gja5Q01231 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gja5Q01231 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gja5Q01231 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gja5Q01231 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja5Q01231 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja5Q01231 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja5Q01231 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja5Q01231 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja5Q01231 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja5Q01231 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja5Q01231 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja5Q01231 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja5Q01231 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja5Q01231 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja5Q01231 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja5Q01231 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja5Q01231 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms