Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2cQ01098 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms