Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms