Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbp4Q00724 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms