Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa1Q00623 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms