Protein–RNA interactions for Protein: P97950

Rab33a, Ras-related protein Rab-33A, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33aP97950 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rab33aP97950 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms