Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rbbp6P97868 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp6P97868 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms