Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cited1P97769 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cited1P97769 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cited1P97769 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited1P97769 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited1P97769 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited1P97769 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms