Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2cP97760 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr2cP97760 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms