Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcc1P97496 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms