Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas1P97459 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas1P97459 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas1P97459 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas1P97459 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas1P97459 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas1P97459 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas1P97459 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms