Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nbr1P97432 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms