Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LystP97412 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LystP97412 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LystP97412 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LystP97412 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LystP97412 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LystP97412 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LystP97412 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LystP97412 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LystP97412 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LystP97412 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LystP97412 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LystP97412 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LystP97412 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LystP97412 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LystP97412 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LystP97412 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LystP97412 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LystP97412 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LystP97412 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LystP97412 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LystP97412 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LystP97412 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LystP97412 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LystP97412 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LystP97412 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LystP97412 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LystP97412 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LystP97412 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LystP97412 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LystP97412 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LystP97412 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LystP97412 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LystP97412 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LystP97412 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LystP97412 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LystP97412 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LystP97412 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LystP97412 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LystP97412 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LystP97412 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LystP97412 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LystP97412 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LystP97412 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LystP97412 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
LystP97412 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
LystP97412 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LystP97412 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LystP97412 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LystP97412 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LystP97412 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LystP97412 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LystP97412 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LystP97412 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LystP97412 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LystP97412 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LystP97412 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LystP97412 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LystP97412 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LystP97412 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LystP97412 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LystP97412 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LystP97412 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LystP97412 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LystP97412 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LystP97412 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LystP97412 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LystP97412 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LystP97412 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LystP97412 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LystP97412 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LystP97412 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LystP97412 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LystP97412 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LystP97412 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LystP97412 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LystP97412 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LystP97412 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LystP97412 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LystP97412 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LystP97412 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LystP97412 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LystP97412 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LystP97412 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LystP97412 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LystP97412 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LystP97412 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LystP97412 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LystP97412 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LystP97412 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LystP97412 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LystP97412 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LystP97412 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LystP97412 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LystP97412 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LystP97412 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LystP97412 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LystP97412 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LystP97412 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LystP97412 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms